بخش مراقبت های ویژه نوزادان یکی از بخش های مهم و پشتیبان بلوک زایمان در مراکز بیمارستانی بوده که محیطی امن برای تولد نوزادان بخصوص نوزادان پرخطر را ایجاد نموده و ارائه خدمات و اقدامات درمانی مناسب را امکانپذیر می سازد . بخش مراقبت های ویژه نوزادان بیمارستان مهرگان قزوین یکی از مراکزپیشرفته فوق تخصصی ارجاع نوزادان در منطقه است که امکان سرویس دهی به کلیه نوزادان نیازمند بستری در این بیمارستان را دارا می باشد . این بخش مجهز به 7تخت شامل 4 عدد تخت احیاء و 3 انكوباتور می باشد و نوزادانی با مشكلات تنفسی، ناهنجاریهای مادرزادی، مشكلات قلبی، وزن كم زمان تولد، آسیفكسی قبل،حین و بعد از زایمان، نارسی، چندقلویی، وزن بالای زمان تولد، سابقه دیابت، فشارخون بالا، و مشكلات داخلی مادر كه به نحوی ممكن است روی نوزاد تاثیرگذار باشند، در این بخش پذیرش می شوند.
این بخش در طبقه دوم بیمارستان در مجاورت بخش های جراحی زنان و بلوک زایمان قرار دارد.